El gobierno de Juan  Orlando Hernández ordenó seguimiento e investigación contra los defensores de derechos humanos Wilfredo Méndez, de CIPRODEH; Dina Meza,  de la Iniciativa Periodismo y Democracia; Hugo Maldonado ,  del CODEH, Jorge Jiménez, del CODEH,  Karla Alegría,  de Vía Campesina; Kenia Oliva , de la Iniciativa Periodismo y Democracia, Cesario Padilla, egresado de periodismo y criminalizado por su liderazgo en la UNAH  y otra persona, a través de una lista que fue entregada a la Dirección Policial de Investigación y al Sistema Estratégico de Recolección, Cotejamiento, Análisis y Archivo de Información, SERCAA, de acuerdo a una fuente que informó a  pasosdeanimalgrande.com que el gobierno los considera “defensores de derechos humanos hostiles al sistema”.

El 8 de Agosto de 2016, el defensor de derechos humanos Jorge Jiménez recibió amenazas de muerte a través de una carta que demandaba que se desligara de su trabajo de derechos humanos en las próximas 24 horas o si no le iban a asesinar. 

El Centro de Investigación y Promoción de los Derechos Humanos, CIPRODEH, en asocio con la Cruz Roja Hondureña,  realizó el taller para periodistas y comunicadores sociales “Trata de Personas, Re victimización de la Víctima y Poder Mediático” .

Luego de su participación en la 105 Asamblea de la Organización Internacional del Trabajo –OIT-, que se llevó a cabo en el mes de junio de este año, en Ginebra, Suiza, el gobierno de Honduras informó de la conformación de una mesa técnica interinstitucional del Convenio 169, integrada por 19 instituciones del Gobierno para la elaboración de una Ley de Consulta.

La legislación laboral en Honduras recorta derechos y precariza el empleo, con especial incidencia en hoteles y restaurantes de "comida chatarra", donde la mano de obra femenina es la que predomina.

Imagínense un proyecto para América Latina en el cual se asegure la paz, la movilidad social y la seguridad para todos sus ciudadanos, sin distinción de raza ni credo. Imagínense una universidad federal bilingüe, de calidad, acogiendo a estudiantes y profesores desde el Sur del Río Grande hasta la Patagonia. Imagínense una generación de jóvenes que, como parte de su experiencia universitaria, estudia por lo menos un año en un país vecino.

En la madrugada del 13 de Julio de 2016, la oficina en San Pedro Sula del Movimiento Amplio por la Dignidad y la Justicia (MADJ), fue objeto de un robo selectivo por parte de un individuo que se apropió únicamente de discos duros, computadoras y cámaras donde se encuentra la información vinculada a las causas judiciales sobre actos emblemáticos de corrupción y violaciones a derechos humanos que se manejan desde el equipo legal de la organización. 

En Honduras, la aprobación de dos leyes han fortalecido las concesiones de los recursos naturales, en la última década: la Ley General de Minería y la Ley de Generación de Energía Eléctrica con Recursos Renovables. La primera, permite la masiva concesión de territorios para la instalación de empresas mineras (metálicas y no metálicas), mientras que la segunda, la concesión de ríos para la construcción de represas hidroeléctricas en el país, según lo señaló el Centro de Estudio para la Democracia, CESPAD, en una alerta emitida este 15 de julio de 2016. 

La UITA envía carta abierta el presidente Hernández ,Tras el asesinato de la ecologista y dirigente comunitaria Lesbia Yaneth Urquía Urquía, el 5 de julio, la Regional Latinoamericana de la UITA envió una carta abierta al presidente de Honduras, Juan Orlando Hernández, exigiendo que se investigue y sancione ese crimen y muchos otros similares cometidos en los últimos años y que permanecen impunes.